Es la dirección que atiende Escrituras publicas de 123 ex notarios (Ver lista de notarios) de la región Puno, asi mismo tambien cuenta con expedientes civiles y penales, se atiende partidas de nacimiento, matrimonio y defunción de toda la región Puno, entre otros documentos.
Dirección de Archivo Histórico
Esta dirección custodia documentación desde 1668 hasta la actualidad, documentos de Prefectura muy consultados, y gran cantidad de documentación de Jueces de Paz, Publicaciones entre otros.
Dirección de Archivo Central
Esta dirección cuenta con documentación interna de la institución, tambien esta encargado de la administración de solicitudes de usuarios actuales, Resoluciones Internar y otra documentación institucional, siguiendo las practicas archivísticas actuales.
Dirección de Sistemas
Esta oficina se encarga de administrar toda la información digital de la institución, bases de datos notarial, sistema de registro civil de 1890 al 2005, sistemas internos y acceso de información.
Oficina Técnica Administrativa
Esta oficina es la encargada de la administracion de la institución, control de personal, Control de almacen, se encuentra la oficina de Planificación y prespuesto entre otras acciones.